প্রফেসর শঙ্কু সত্যজিৎ রায়ের সৃষ্ট আরেকটি উল্লেখযোগ্য এবং জনপ্রিয় চরিত্র। তিনি একজন বাঙালি বিজ্ঞানী, যিনি তাঁর বিভিন্ন বৈজ্ঞানিক উদ্ভাবন এবং আবিষ্কারের জন্য পরিচিত। শঙ্কুর চরিত্রটি প্রথম আত্মপ্রকাশ করে "আবিষ্কার" গল্পে।
প্রফেসর শঙ্কু তাঁর বিভিন্ন উদ্ভাবন এবং অসাধারণ বুদ্ধিমত্তার জন্য পাঠকদের মনে জায়গা করে নিয়েছেন। তাঁর উদ্ভাবনগুলির মধ্যে অন্যতম হলো "অ্যানিহিলিন," যা একটি এনার্জি পিস্তল। এই পিস্তলটি অত্যন্ত শক্তিশালী, যা জীবিত কোনো বস্তুকে ধ্বংস বা বাষ্পে পরিণত করতে সক্ষম। তবে প্রফেসর শঙ্কুর একটি বিশেষ গুণ হলো, তিনি রক্তপাত পছন্দ করেন না এবং সে কারণেই এই পিস্তলটি উদ্ভাবন করেন।
"অ্যানিহিলিন" কেবল জীবিত জিনিসের উপর কাজ করে, এবং কোনো অনির্ভর বা অস্পষ্ট বস্তুতে কাজ করে না। এই পিস্তলের ক্ষমতা নিয়ে প্রফেসর শঙ্কু একটি দুঃসাহসিক অভিযানেও গিয়েছিলেন, যা "শঙ্কুর কঙ্গো অভিযান" গল্পে বর্ণিত হয়েছে। প্রফেসর শঙ্কুর এই উদ্ভাবন তাঁর চরিত্রের গভীরতা এবং বিজ্ঞানচেতনার প্রমাণ, যা সত্যজিৎ রায়ের সৃষ্ট অন্য চরিত্রগুলোর মতোই পাঠকদের মাঝে চিরকালীন জনপ্রিয়তা লাভ করেছে।