ফারাক্কা ব্যারাজ প্রাথমিকভাবে কলকাতা বন্দরের নাব্যতা সমস্যা সমাধানের জন্য নির্মাণ করা হয়েছিল, যা ব্যবসা-বাণিজ্যের জন্য অত্যন্ত গুরুত্বপূর্ণ ছিল। হুগলি নদীতে পলি জমার কারণে বন্দরটি গুরুতর নাব্যতা সমস্যার সম্মুখীন হয়েছিল। উদ্দেশ্য ছিল ফারাক্কা ব্যারাজের মাধ্যমে গঙ্গা থেকে জল সরিয়ে, হুগলি নদীতে পলি বের করে পানি প্রবাহ উন্নত করা, যার ফলে বন্দরের কার্যকারিতা বজায় রাখা যায়।
ব্যারাজের নির্মাণ কাজ 1961 সালে শুরু হয়েছিল এবং 1975 সালে শেষ হয়েছিল। প্রকল্পটি এই অঞ্চলে সেচ এবং জল সরবরাহকে উন্নত করারও উদ্দেশ্যে গ্রহণ করা হয়েছিল।অথচ ফারাক্কার পানির অপসারণ বাংলাদেশের উপর উল্লেখযোগ্য নিম্নধারার প্রভাব ফেলেছে, যার ফলে বিরোধ এবং সহযোগিতামূলক পানি ব্যবস্থাপনার প্রয়োজন দেখা দিয়েছে।